Tijdens deze behandeling wordt de zenuw uit de tand verwijderd en wordt de lege ruimte die ontstaat goed schoon gemaakt en opgevuld met een speciaal wortelkanaalcement. Op deze manier wordt de ontstekingshaard verwijderd en wordt voorkomen dat de ontsteking zich verder kan uitbreiden. De behandeling bestaat uit het schoonmaken van de geïnfecteerde wortelkanalen en het spoelen met desinfecterende vloeistof, om de ontsteking te verwijderen. Na afloop van de behandeling wordt een röntgenfoto gemaakt ter controle. Het is verstandig om na verloop van tijd de tand of kies te voorzien van een kroon, om lekkage en eventuele breuk na uitdroging van het element te voorkomen.

Een andere reden waarom een wortelkanaalbehandeling nodig kan zijn is om extra houvast voor een kroon of brug te verkrijgen.